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primeira posição |
segunda posição |
terceira posição |
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G |
A |
C |
U |
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G |
G |
E |
A |
V (s2d, s4d, s5b, s11) |
G |
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G |
E |
A |
V (s4d(?)) |
A |
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G |
D |
A |
V |
C |
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G |
D |
A |
V |
U |
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A |
R (2: *)(5,9,14: S) (13: G) |
K |
T |
M |
G |
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R (2: *)(5,9,14: S) (13: G) |
K (9,14: N) |
T |
I (s4b, s4c, s4d, s5) (2,3,5,13: M) |
A |
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S |
N |
T |
I (s2c, s2d, s4d, s5a) |
C |
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|
S |
N |
T |
I (s2b, s2c, s2d, s4b, s4c, s4d, s5, s11) |
U |
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|
C |
R |
Q |
P |
L (s1, s4a, s11) (3: T) (12: S) |
G |
|
R (3: a) |
Q |
P |
L (3: T) |
A |
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|
R (3: a) |
H |
P |
L (3: T) |
C |
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R |
H |
P |
L (3: T) |
U |
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|
U |
W |
* (6,15: Q) |
S |
L (s1, s4a, s5c, s11) |
G |
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* (2,3,4,5,9,13,14: W)(10:C) |
* (6: Q) (14: Y) |
S |
L (s4a) |
A |
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C |
Y |
S |
F |
C |
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|
C |
Y |
S |
F |
U |
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* = codons utilizados para sinalizar o final de um gene
s = diferença do código correspondente que ocorre quando um codon vem no começo (starts)
a = ausente (absent)
Os números de 1 a 15 representam os seguintes códigos:
1) Código padrão
2) Código mitocondrial de vertebrados(vertebrate)
3) Código mitocondrial de leveduras (yeast)
4) Código mitocondrial de fungos (mold), protozoários (protozoan) e celenterados (coelenterate) e código de mycoplasma/spiroplasma (mycoplasma/spiroplasma)
5) Código mitocondrial de invertebrados (invertebrate)
6) Código nuclear de ciliados (ciliate), dasycladacean (dasycladacean) e hexamita (hexamita)
7) tabela não disponível
8) tabela não disponível
9) Código mitocondrial de equinodermos (echinoderm)
10) Código nuclear de euplotid (euplotid)
11) "Código" bacterial (bacterial)
12) Código nuclear alternativo de leveduras (yeast)
13) Código mitocondrial de ascidian (ascidian)
14) Código mitocondrial de flatworm (flatworm)
15) Código nuclear de blepharisma (blepharisma)
Algumas informações sobre codons de início não são únicas para um mesmo grupo. As subdivisões necessárias são indicadas abaixo:
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2a - Bos 2b - Homo 2c - Mus 2d - Coturnix, Gallus |
4a - Trypanosoma 4b - Leishmania 4c - Tertrahymena 4d - Paramecium |
5a - Apis 5b - Polyplacophora 5c - Ascaris, Caenorhabditis |
Essas subdivisões são usadas apenas nos parênteses do tipo (i) (veja explicação abaixo).
Observação: na tabela utiliza-se tanto "s5" quando "s5a", "s5b" e "s5c". Deve estar claro que "s5" representa todo o grupo e "s5x" representa apenas a subdivisão correspondente.
Os primeiros aminoácidos indicados em cada célula da tabela representam a codificação padrão. Entre parênteses estão indicados os aminoácidos das codificações 2 a 15 (caso sejam diferentes do padrão).
Há dois tipos de parênteses em cada célula:
(i) formado por seqüências começadas por "s". Exemplo:
(s2d, s4d, s5b, s11)Indica que, se o codon ocorrer, no início, em um elemento de um dos grupos, estará codificando o aminoácido "M". No exemplo os grupos são 2d, 4d, 5b e 11. Há no máximo um parênteses do tipo (i) por célula.
(ii) formado por uma seqüência de números, seguida de uma letra. Exemplo: (6,15: Q)
Indica que, se o codon ocorrer em um elemento de um dos grupos, estará codificando o aminoácido indicado. No exemplo os grupos são 6 e 15 e o aminoácido indicado é Q. Pode haver mais de um parênteses desse tipo por célula, um para cada aminoácido diferente do padrão.
Exemplo - célula CUG:
L (s1, s4a, s11) (3: T)Em princípio, o codon CUG codifica o aminoácido L. No entanto, se este codon aparece no início, em um elemento dos grupos 1, 4a ou 11, codifica o aminoácido M. Por outro lado, se este codon aparece em um elemento do grupo 3 (no início ou não), codifica o aminoácido T.
fonte: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/htbin-post/Taxonomy/wprintgc?mode=c
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Denise Guarnieri Batista |
RA 950450 |
7 de Abril de 1999 |