MO640 - Exercícios - Para 2004-09-15

  1. Considere as seqüências abaixo, sendo a primeira delas ancestral e a outra descentente:

    CTAGGCTTACGATTACGAGGATCCAAATGGCACCAATGCT
    CTACGCTTACGACAACGAGGATCCGAATGGCACCATTGCT

    1. Qual é a taxa observada de mutações por posição?
    2. Qual é a taxa estimada mutações por posição supondo o modelo Jukes-Cantor de evolução?
  2. Considere as tabelas abaixo, onde a célula XY indica o número de posições onde a seqüência S1 (ancestral) tem X e a seqüência S2 (descendente) tem Y.
    S1\S2
    		 A
    		 G
    		 C
    		 T
    A
    		 92
    		 15
    		 2
    		 2
    G
    		 13
    		 84
    		 4
    		 4
    C
    		 0
    		 1
    		 77
    		 16
    T
    		 4
    		 2
    		 14
    		 70
    S1\S2
    		 A
    		 G
    		 C
    		 T
    A
    		 90
    		 3
    		 3
    		 2
    G
    		 3
    		 79
    		 8
    		 2
    C
    		 2
    		 4
    		 96
    		 5
    T
    		 5
    		 1
    		 3
    		 94

    Para cada uma delas, decida qual modelo (Jukes-Cantor ou Kimura) é mais apropriado e calcule as respectivas taxas de mutação (caso seja Jukes-Cantor), ou de transição e transversão (caso seja Kimura), por posição.

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