MO640 - Textos

Criada: 2004-08-22
Terminada: 2004-08-25

A lista abaixo enumera os textos que serão usados na disciplina. Todos eles exceto os trechos do livro de Setubal e Meidanis (1997) estão disponíveis no Xerox do Instituto de Artes. Alguns deles têm versão eletrônica disponível nesta página.

  1. Meidanis 2003a - MEIDANIS, J. Current Challenges in Bioinformatics. Invited talk at SPIRE 2003, Manaus, Brasil.
  2. Meidanis 2003b - MEIDANIS, J. Current Challenges in Bioinformatics. In: M. A. Nascimento, E. S. Moura, A. L. Oliveira (Eds.): SPIRE 2003 - Proceedings of the Workshop on String Processing and Information Retrieval. LNCS 2857, pp. 16-27, 2003. Springer-Verlag.
  3. Setubal e Meidanis 1997 - SETUBAL, J. C.; MEIDANIS, J. Introduction to Computational Molecular Biology. PWS Publishing Company, 1997.
  4. Quitzau 2004a - QUITZAU, J. A. A. Modelos de Evolução. Tese de Mestrado, IC-Unicamp, cap. 3. Defesa prevista: 2004.
  5. Booth e Leuker 1976 - BOOTH, K. S.; LEUKER, G. S. Testing for the Consecutive Ones Property, Interval Graphs, and Graph Planarity Using PQ-Tree Algorithms. J. of Computer and Systems Sciences, 13, 335-379 (1976).
  6. MPT 1998 - MEIDANIS, J.; PORTO, O.; TELLES, G. P. On the consecutive ones property. Discrete Applied Mathematics, 88, 325-354 (1998).
  7. Meidanis e Telles 2004 - TELLES, G. P.; MEIDANIS, J. Building PQR Trees in Almost-Linear Time. Submetido a publicação, 2004.
  8. Jacy Monteiro 1974 - JACY MONTEIRO, L. H. Elementos de Álgebra, Livros Técnicos e Científicos Editora, Rio de Janeiro, 1974.
  9. Dias 2002 - DIAS, Z. An Alternative Algebraic Formalism for Genome Rearrangements. In: Dias, Z., Rearranjo de Genomas: Uma Coletânea de Artigos, Tese de Doutorado, IC-Unicamp, cap. 6. Defendida em 2002.
  10. MWD 2002 - MEIDANIS, J.; WALTER, M. E. M. T.; DIAS, Z. A Lower Bound on the Reversal and Transposition Diameter. J. of Computational Biology, Vol.9, No.5, pp. 743-745, 2002.
  11. DFM 2004 - DIAS, Z.; FORTUNA, V.; MEIDANIS, J. Sorting by Prefix Transpositions. Submetido a publicação, 2004.
  12. Fortuna e Meidanis 2004 - FORTUNA, V.; MEIDANIS, J. Sorting the Reverse Permutation by Prefix Transpositions. Relatório Técnico IC-04-04, IC-Unicamp, 2004.
  13. Bergeron - BERGERON, A. A Very Elementary Presentation of the Hannenhalli-Pevzner Theory. Aceito para publicação, Discrete Applied Mathematics, 2003.
  14. Quitzau 2004b - QUITZAU, J. A. A. Grafos, Cortes, Subgrupos e Árvores Filogenéticas. Tese de Mestrado, IC-Unicamp, cap. 3. Defesa prevista: 2004.

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