MO640 - Cronograma
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última modificação: |
3/16/05 |
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| S/Q |
Dia |
Mês |
Atividade |
Texto |
Tópicos |
Exercícios |
Soluções |
| Q |
2 |
Mar |
Apresentação |
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| S |
7 |
Mar |
Challenges |
Meidanis 2003a, b |
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Lista |
Solução |
| Q |
9 |
Mar |
Education |
Pevzner 2004 |
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Lista |
Solução |
| S |
14 |
Mar |
Conceitos Bio. Mol. |
SM 1997 |
cap. 1 |
Lista |
Solução |
| Q |
16 |
Mar |
Conceitos Comput. |
SM 1997 |
cap. 2 |
Lista |
Solução |
| S |
21 |
Mar |
Cadeias de Markov |
Ewens e Grant 2001 |
sec. 10.7 |
Lista |
Solução |
| Q |
23 |
Mar |
Jukes-Cantor, Kimura |
Ewens e Grant 2001 |
sec. 13.3 |
Lista |
Solução |
| S |
28 |
Mar |
Comp. seqüências |
SM 1997 |
cap. 3: global, local |
Lista |
Solução |
| Q |
30 |
Mar |
Prova Individual 1 |
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cai até 23/Mar |
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| S |
4 |
Abr |
Comp. seqüências |
SM 1997 |
cap. 3: semi, esp. linear |
Lista |
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| Q |
6 |
Abr |
Comp. seqüências |
SM 1997 |
cap. 3: afim, seq. simil. |
Lista |
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| S |
11 |
Abr |
Comp. genomas |
Meid. 2004, Alm. 2005 |
operações de rearranjo |
Lista |
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| Q |
13 |
Abr |
Ident. estr. homólogas |
McLysaght et al. 2003 |
somente homologia |
Lista |
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| S |
18 |
Abr |
Distância sintênica |
Dias e Meidanis 2002a |
somente fusão e fissão |
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| Q |
20 |
Abr |
Dist. de reversão - HP |
Hannenhalli et al. 1999 |
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| S |
25 |
Abr |
Dist. de reversão - KST |
Kaplan et al. 1997 |
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| Q |
27 |
Abr |
Prova Grupal 1 |
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cai até 20/Abr |
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| S |
2 |
Mai |
Dist. de reversão - Bergeron |
Bergeron 2005 |
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| Q |
4 |
Mai |
Dist. de transposição |
Bafna e Pevzner 1998 |
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| S |
9 |
Mai |
CBMP 2005 |
não haverá aula |
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| Q |
11 |
Mai |
CBMP 2005 |
não haverá aula |
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| S |
16 |
Mai |
Rn por transposição |
Meidanis et al. 1997 |
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| Q |
18 |
Mai |
Dist. transp. - casos fáceis |
DM 2002b, Fort. 2005 |
Fort.2005:apenas faceis |
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| S |
23 |
Mai |
Dist. block interchange |
Christie 1996 |
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| Q |
25 |
Mai |
Rn por rev. e transp. |
Walter et al. 1999 |
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| S |
30 |
Mai |
Prova Individual 2 |
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cai até 23/Mai |
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| Q |
1 |
Jun |
Dist. fusão, fissão e transp. |
Meidanis e Dias 2001 |
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| S |
6 |
Jun |
Estrutura fina genes |
Benzer 1959 |
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| Q |
8 |
Jun |
Árvores PQ |
Booth e Lueker 1976 |
definições, exemplos |
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| S |
13 |
Jun |
Árvores PQ |
Booth e Lueker 1976 |
algoritmo, complexidade |
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| Q |
15 |
Jun |
Árvores PQR |
Meidanis et al. 1998 |
definições, propriedades |
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| S |
20 |
Jun |
Árvores PQR |
Meidanis et al. 1998 |
decomp., primas, alg. |
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| Q |
22 |
Jun |
Árvores PQR |
Meidanis e Telles 2004 |
alg. quase-linear |
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| S |
27 |
Jun |
Árvores PQR |
Meidanis e Telles 2004 |
implementação, jogo |
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| Q |
29 |
Jun |
Prova Grupal 2 |
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cai até 27/Jun |
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| S |
4 |
Jul |
Estudos |
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| Q |
6 |
Jul |
Estudos |
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| S |
11 |
Jul |
Exame |
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| Q |
13 |
Jul |
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| S |
15 |
Jul |
Entrega notas finais |
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