MO640 - Exercícios - Sobre a aula de 2007-03-14

1. Crie uma planilha eletrônica que construa a matriz necessária para calcular a similaridade global entre suas seqüências S e T.
2. Calcule a similaridade global entre as seqüências: AGTCGTGAC e CGTAGTCCGTGAT. Use pontuação match=1, mismatch=0, gap=-1. Faça primeiro na mão e depois confira com a sua planilha.
3. Crie uma planilha eletrônica que construa a matriz necessária para calcular a similaridade local entre suas seqüências S e T.
4. Calcule a similaridade local entre as seqüências: AGTCGTGAC e CGTAGTCCGTGAT. Use pontuação match=1, mismatch=-1, gap=-2. Faça primeiro na mão e depois confira com a sua planilha.
5. Faça uma planilha que calcule a similaridade de sufixos através de uma matriz U tal que U(i,j) = similaridade(S[i+1..m],T[j+1..n]). Depois faça uma matriz que seja a soma de V com U. Qual é a característica interessante desta matriz soma?

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