MO640 - Questão para a prova oral
Número: 064
Enunciado:
Sobre o algoritmo de montagem de DNA utilizando super-caminhos de Euler podemos afirmar que:
- ele é mais eficiente porque diminui consideravelmente o numero de reads.
- para lidar com repeats ele tenta mascará-los, montando um grafo onde eles não apareçam
- o número de contigs aumenta quando se compara a algoritmos de montagem clássicos como o da Celera
- na montagem de seu grafo, ele usa muito mais reads, mas
diminui o número de contigs ao final
- NDA
Autor(a): Danilo Brandão Gonçalves