MO640 Cronograma |
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2008-08-06 |
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T/Q |
Data |
Atividade |
Texto |
Tópicos |
Exercícios |
Soluções |
T |
05/Ago |
Apresentação |
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Q |
07/Ago |
Conceitos biologia molecular |
Beginner's guide |
quanto der |
Enunciado |
Sol. (Andréia) |
T |
12/Ago |
Conceitos biologia molecular |
Beginner's guide |
restante |
Enunciado |
Solução (Maria) |
Q |
14/Ago |
Comparação global |
Setubal e Meidanis 1997 |
cap.3, glob. |
Enunciado |
Sol. (Gustavo) |
T |
19/Ago |
PharmaCongress 2008 |
Pevzner 2004; Eddy 2005 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Tiago) |
Q |
21/Ago |
Comparação local, semi-global |
Setubal e Meidanis 1997 |
cap.3,loc.se. |
Enunciado |
Solução (Pedro) |
T |
26/Ago |
Espaço linear, seqs. similares |
Setubal e Meidanis 1997 |
cap.3,lin.sim. |
Enunciado |
Solução (Bruno) |
Q |
28/Ago |
BSB 2008 |
Doolitle 2000 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Filipe) |
T |
02/Set |
Modelo de Jukes-Cantor |
Quitzau 2005 |
p. 41 a 44 |
Enunciado |
Sol. (J.Paulo) |
Q |
04/Set |
Modelo de Kimura - 2 parâmetros |
Quitzau 2005 |
p. 44 a 50 |
Enunciado |
Solução (Fábio) |
T |
09/Set |
Prova I1 |
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Q |
11/Set |
Filogenia – introdução |
Felsenstein 2004 |
p. 1 a 18 |
Enunciado |
Solução (Danilo) |
T |
16/Set |
Sanduíche ultramétrico |
Farach et al. 1995 |
sec. 1 a 4 |
Enunciado |
Solução (Victor) |
Q |
18/Set |
Inferência de haplótipos |
Gusfield e Orzack 2001 |
tudo |
Enunciado |
Sol. (Priscila) |
T |
23/Set |
Montagem de fragmentos-CAP3 |
Huang e Madan 1999 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Vepe) |
Q |
25/Set |
Montagem de fragmentos-EULER |
Pevzner et al 2001 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Rajiv) |
T |
30/Set |
Montagem de eucariotos |
Salzberg 2005; Zimin 2008 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Filipe) |
Q |
02/Out |
Rearranjo genomas: transposição |
Bafna e Pevzner 1998 |
defs/results |
Enunciado |
Solução
(Fábio) |
T |
07/Out |
Prova G1 |
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Q |
09/Out |
Rearranjo por reversões |
Mneimneh 2004 |
lec. 16 |
Enunciado |
Solução
(Maria) |
T |
14/Out |
Rearranjo por reversões |
Mneimneh 2004 |
lec. 17 |
Enunciado |
Solução (Tiago) |
Q |
16/Out |
Distância de reversão |
Bader et al 2001 |
tudo |
Enunciado |
Solução(Bruno) |
T |
21/Out |
Double cut and join |
Yancopoulos et al 2005 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Priscila) |
Q |
23/Out |
Rearranjo: translocações |
Bergeron et al 2006 |
tudo |
Enunciado |
Solução
(Danilo) |
T |
28/Out |
Não haverá aula |
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Q |
30/Out |
Estrutura fina dos genes |
Benzer 1959 |
pular f.units |
Enunciado |
Solução
(Gustavo) |
T |
04/Nov |
Prova I2 |
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Q |
06/Nov |
Propriedade uns consecutivos |
Booth e Lueker 1975 |
definições |
Enunciado |
Solução
(Victor) |
T |
11/Nov |
Propriedade uns consecutivos |
Booth e Lueker 1975 |
algoritmos |
Enunciado |
Solução
(J.Paulo/Meidanis) |
Q |
13/Nov |
Árvores PQR |
Meidanis et al 1998 |
defs, props. |
Enunciado |
Solução
(Meidanis) |
T |
18/Nov |
Árvores PQR |
Meidanis et al 1998 |
nós, algorit. |
Enunciado |
Solução (Meidanis) |
Q |
20/Nov |
Não haverá aula |
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T |
25/Nov |
Construção quase linear de PQR |
Telles e Meidanis 2007 |
tudo |
Enunciado |
Solução (Pedro) |
Q |
27/Nov |
Exercícios de revisão |
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T |
02/Dez |
Prova G2 |
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Q |
04/Dez |
Estudos |
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T |
09/Dez |
Exame (apenas para graduação) |
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Q |
11/Dez |
Estudos |
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