MO640 Cronograma
		2008-08-06
T/Q	Data	Atividade	Texto	Tópicos	Exercícios	Soluções
T	05/Ago	Apresentação
Q	07/Ago	Conceitos biologia molecular	Beginner's guide	quanto der	Enunciado	Sol. (Andréia)
T	12/Ago	Conceitos biologia molecular	Beginner's guide	restante	Enunciado	Solução (Maria)
Q	14/Ago	Comparação global	Setubal e Meidanis 1997	cap.3, glob.	Enunciado	Sol. (Gustavo)
T	19/Ago	PharmaCongress 2008	Pevzner 2004; Eddy 2005	tudo	Enunciado	Solução (Tiago)
Q	21/Ago	Comparação local, semi-global	Setubal e Meidanis 1997	cap.3,loc.se.	Enunciado	Solução (Pedro)
T	26/Ago	Espaço linear, seqs. similares	Setubal e Meidanis 1997	cap.3,lin.sim.	Enunciado	Solução (Bruno)
Q	28/Ago	BSB 2008	Doolitle 2000	tudo	Enunciado	Solução (Filipe)
T	02/Set	Modelo de Jukes-Cantor	Quitzau 2005	p. 41 a 44	Enunciado	Sol. (J.Paulo)
Q	04/Set	Modelo de Kimura - 2 parâmetros	Quitzau 2005	p. 44 a 50	Enunciado	Solução (Fábio)
T	09/Set	Prova I1
Q	11/Set	Filogenia – introdução	Felsenstein 2004	p. 1 a 18	Enunciado	Solução (Danilo)
T	16/Set	Sanduíche ultramétrico	Farach et al. 1995	sec. 1 a 4	Enunciado	Solução (Victor)
Q	18/Set	Inferência de haplótipos	Gusfield e Orzack 2001	tudo	Enunciado	Sol. (Priscila)
T	23/Set	Montagem de fragmentos-CAP3	Huang e Madan 1999	tudo	Enunciado	Solução (Vepe)
Q	25/Set	Montagem de fragmentos-EULER	Pevzner et al 2001	tudo	Enunciado	Solução (Rajiv)
T	30/Set	Montagem de eucariotos	Salzberg 2005; Zimin 2008	tudo	Enunciado	Solução (Filipe)
Q	02/Out	Rearranjo genomas: transposição	Bafna e Pevzner 1998	defs/results	Enunciado	Solução (Fábio)
T	07/Out	Prova G1
Q	09/Out	Rearranjo por reversões	Mneimneh 2004	lec. 16	Enunciado	Solução (Maria)
T	14/Out	Rearranjo por reversões	Mneimneh 2004	lec. 17	Enunciado	Solução (Tiago)
Q	16/Out	Distância de reversão	Bader et al 2001	tudo	Enunciado	Solução(Bruno)
T	21/Out	Double cut and join	Yancopoulos et al 2005	tudo	Enunciado	Solução (Priscila)
Q	23/Out	Rearranjo: translocações	Bergeron et al 2006	tudo	Enunciado	Solução (Danilo)
T	28/Out	Não haverá aula
Q	30/Out	Estrutura fina dos genes	Benzer 1959	pular f.units	Enunciado	Solução (Gustavo)
T	04/Nov	Prova I2
Q	06/Nov	Propriedade uns consecutivos	Booth e Lueker 1975	definições	Enunciado	Solução (Victor)
T	11/Nov	Propriedade uns consecutivos	Booth e Lueker 1975	algoritmos	Enunciado	Solução (J.Paulo/Meidanis)
Q	13/Nov	Árvores PQR	Meidanis et al 1998	defs, props.	Enunciado	Solução (Meidanis)
T	18/Nov	Árvores PQR	Meidanis et al 1998	nós, algorit.	Enunciado	Solução (Meidanis)
Q	20/Nov	Não haverá aula
T	25/Nov	Construção quase linear de PQR	Telles e Meidanis 2007	tudo	Enunciado	Solução (Pedro)
Q	27/Nov	Exercícios de revisão
T	02/Dez	Prova G2
Q	04/Dez	Estudos
T	09/Dez	Exame (apenas para graduação)
Q	11/Dez	Estudos