MO640 - Exercícios - Sobre a aula de 2008-09-25

Considerando os seguintes fragmentos (reads) de DNA
ATCCGTTGAAGCCGCGGGC
TTAACTCGAGG
TTAAGTACTGCCCG
ATCTGTGTCGGG
CGACTCCCGACACA
CACAGATCCGTTGAAGCCGCGGG
CTCGAGTTAAGTA
CGCGGGCAGTACTT
, determine todos as sobreposições (overlaps) de 5 ou mais caracteres. Não esqueça de considerar os complementos reversos dos fragmentos.
Tente montar as seqüências acima em um único contig. Há erros de seqüenciamento (base call errors)? Qual o comprimento do consenso resultante?