MO640 - Biologia Computacional (MC668 - Bioinformática)

Turma A - Primeiro Semestre de 2010

Conteúdo desta página

Avisos Importantes

Docente

Auxiliar Didático

Dias, Horários e Local das Aulas

Segundas e quartas das 16:00h às 18h:00h na sala 322 do IC-3.

Dia, Horário e Local de Atendimento

Segundas e quartas, das 18:00h às 18:30h, na sala 23 do IC-1.

Importante: não haverá atendimento em dia de prova.

Pré-Requisitos

Ementa

Referências Bibliográficas
An Introduction to Bioinformatics Algorithms.
Neil C. Jones & Pavel A. Pevzner.
The MIT Press (2004).
Introduction to Computational Molecular Biology.
João Carlos Setubal & João Meidanis.
PWS Publishing (1997).
Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach.
Pavel A. Pevzner.
The MIT Press (2000).
Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology.
Dan Gusfield.
Cambridge University Press (1997).
Introduction to Computational Biology: Maps, Sequences and Genomes.
Michael S. Waterman.
Chapman & Hall/CRC (1995).
Knowledge Discovery in Bioinformatics: Techniques, Methods, and Applications.
Xiaohua Hu & Yi Pan.
Wiley-Interscience (2007).
Introduction to Algorithms (Second Edition).
Thomas Cormen, Charles Leiserson, Ronald Rivest & Clifford Stein.
McGraw-Hill (2003).
Introduction to Algorithms (First Edition).
Thomas Cormen, Charles Leiserson & Ronald Rivest.
MIT Press (1990).
Algoritmos - Teoria e Prática.
Thomas Cormen, Charles Leiserson, Ronald Rivest & Clifford Stein.
Editora Campus (2002).
Introduction to Algorithms: A Creative Approach.
Udi Manber.
Addison Wesley (1989).

Material Didático

Listas de Exercícios

Avaliação

A avaliação será baseada nas notas de três provas e de uma série de listas de exercícios, denotados, respectivamente, por P1, P2, P3 e L.

Haverá, no mínimo, um intervalo de 5 dias entre a divulgação da lista e a data de entrega (que será sempre num dia de aula). As listas deverão ser entregues no começo da aula. Não serão aceitas listas entregues fora do prazo (tolerância máxima de 30 minutos). Apesar de discussões em grupo serem incentivadas nesta disciplina, a redação das respostas das listas deverá ser feita individualmente. Só serão aceitas listas escritas a mão, com letra legível. As listas poderão ser entregues incompletas, mas cada exercício entregue deve estar completamente resolvido. O número de listas de exercícios durante o curso deverá variar entre 5 e 15. Cada lista será composta por no máximo 10 exercícios.

Serão atribuidas notas às listas de exercícios. Idealmente todos os exercícios serão corrigidos. Na prática, a critério exclusivo do docente, poderão ser utilizados outras formas para atribuir notas às listas, por exemplo:

  1. Atribuição de nota máxima para quem entregou e zero para quem não entregou.
  2. Atribuição de uma nota proporcional ao numero de exercícios entregues.
  3. Correção de um (ou mais) exercício(s) escolhido(s) aleatoriamente. Neste caso o mesmo sub-conjunto de exercícios será considerado para todos os alunos. Caso o exercício escolhido não tiver sido entregue será atribuida nota zero.
  4. Uma combinação destes ou de outros métodos.

A nota L será calculada como a média aritmética simples entre todas as listas de exercícios do semestre.

A média do semestre M será calculada pela fórmula:

M = (L + 3*P1 + 3*P2 + 3*P3)/10

No caso de alunos de pós-graduação, o conceito final será atribuído da seguinte forma:

  1. A: se M ≥ 8.5
  2. B: se 7.0 ≤ M < 8.5
  3. C: se 5.0 ≤ M < 7.0
  4. D: se M < 5.0

No caso de alunos de alunos de graduação, será aplicada a seguinte regra:

  1. Aprovado: se M ≥ 5.0
  2. Reprovado: se M < 5.0

Observações:

  1. Não haverá provas substitutivas.
  2. Por se tratar de uma disciplina avançada, e de acordo com o Catálogo de Graduação da Unicamp, não haverá exame final.
  3. As provas serão realizados sem consulta.
  4. Qualquer tentativa de fraude nas provas ou nas listas de exercícios implicará em média final (M) do semestre igual a ZERO para todos os envolvidos, sem prejuízo de outras sansões.
  5. Não será cobrada presença em sala de aula.

Notas

Consulte as notas aqui.

Datas Importantes

Observações:

  1. Visite a página do Calendário oficial da DAC para saber quais as datas de alteração de matrícula, de trancamento de disciplinas e dos períodos sem atividade.
  2. Todas as notas serão divulgadas em até duas semanas após as datas das provas e da entrega das listas de exercícios.