[15/11/2024] Divulgadas as notas da segunda prova. As provas estarão disponíveis para consulta nos dias 18 e 25/11/2024 (segundas-feiras), após as aulas (até as 16h30), na sala 23 do IC-1.
[26/09/2024] Divulgadas as notas da primeira prova. As provas estarão disponíveis para consulta nos dias 26 (quinta-feira) e 27/09/2024 (sexta-feira), das 16h30 às 18h, e também no dia 30/09/2024 (segunda-feira), das 16h às 17h, na sala 23 do IC-1.
[01/08/2024] Nos dias 12/08/2024 (segunda-feira), 14/08/2024 (quarta-feira), 19/08/2024 (segunda-feira) e 21/08/2024 (quarta-feira), as aulas da disciplina serão substituídas por uma série de seminários sobre biologia molecular e bioinformática, que acontecerão no mesmo horário das aulas (das 14h às 16h), no Auditório do IC-3. Os seminários serão ministrados por Felipe Rodrigues da Silva, pesquisador do Laboratório de Bioinformática Aplicada da Embrapa e professor do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular (PPG-GBM) da Unicamp.
[07/05/2024] As aulas desta disciplina programadas para os dias 05/08/2024 (segunda-feira) e 07/08/2024 (quarta-feira) serão substituídas pelas atividades da SECOMP 2024 (Semana de Computação da Unicamp), a ser realizada entre os dias 05 e 09 de Agosto de 2024 no Instituto de Computação da Unicamp. Recomenda-se fortemente que os alunos participem das atividades programadas.
[07/05/2024] Site da disciplina no ar.
Segundas e quartas, das 14h às 16h, na sala 351 do IC-3.5.
Observações:
An Introduction to Bioinformatics Algorithms. Neil C. Jones & Pavel A. Pevzner. The MIT Press (2004). |
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Introduction to Computational Molecular Biology. João Carlos Setubal & João Meidanis. PWS Publishing (1997). |
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Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach. Pavel A. Pevzner. The MIT Press (2000). |
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Algorithms on Strings, Trees and Sequences: Computer Science and Computational Biology. Dan Gusfield. Cambridge University Press (1997). |
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Introduction to Computational Biology: Maps, Sequences and Genomes. Michael S. Waterman. Chapman & Hall/CRC (1995). |
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Knowledge Discovery in Bioinformatics: Techniques, Methods, and Applications. Xiaohua Hu & Yi Pan. Wiley-Interscience (2007). |
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Introduction to Algorithms (Third Edition). Thomas Cormen, Charles Leiserson, Ronald Rivest & Clifford Stein. McGraw-Hill (2009). |
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Introduction to Algorithms (Second Edition). Thomas Cormen, Charles Leiserson, Ronald Rivest & Clifford Stein. McGraw-Hill (2003). |
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Algoritmos - Teoria e Prática. Thomas Cormen, Charles Leiserson, Ronald Rivest & Clifford Stein. Editora Campus (2002). |
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Introduction to Algorithms: A Creative Approach. Udi Manber. Addison Wesley (1989). |
O material didático será publicado na página da disciplina, uma vez por semana, após as aulas daquela semana.
Listas de exercícios serão sugeridas ao longo do semestre. Além de servir para fixação do material apresentado em sala de aula, o conteúdo dos exercícios é considerado parte integrante do material visto e será assumido como parte da matéria coberta. Como as listas não farão parte da avaliação, suas soluções não serão coletadas. Os alunos são encorajados a resolver todos os exercícios individualmente e, só posteriormente, realizar discussão em grupo. Dificuldades encontradas nos exercícios podem ser discutidas nos horários de atendimentos, após as aulas.
A avaliação será baseada nas notas de duas provas e de um trabalho, denotados, respectivamente, por P1, P2 e T.
O enunciado do trabalho será divulgado, no mínimo, com quatro semanas de antecedência em relação a data de entrega do mesmo.
A média do semestre M será calculada pela fórmula:
No caso de alunos de pós-graduação, o conceito final será atribuído da seguinte forma:
No caso de alunos de alunos de graduação, será aplicada a seguinte regra:
Observações:
Consulte as notas aqui.
Observações: