13 dez 2019
20:00 Auditório 1
Tema
High Performance Collision Cross Section (HPCCS) HPC Techniques to Accelerate the Collision Cross Section Calculation
Aluno
Leandro Negri Zanotto
Orientador / Docente
Guido Costa Souza de Araújo
Breve resumo
A técnica de Mobilidade Iônica junto com a Espectrometria de Massa (IM-MS) tem sido utilizada desde 2003 por laboratórios de pesquisa e análises, quando foram introduzidos os primeiros equipamentos comerciais. Ela é usada como uma ferramenta de separação molecular, técnica cromatográfica e também para obter informação estrutural de íons moleculares. A interpretação dos dados obtidos ainda é um desafio, dependendo dos cálculos da seção de choque transversal (CCS) contra um gás de arraste. Este trabalho, apresenta um novo software, \textit{High Performance Collision Cross Section} - HPCCS, que, baseado no método de trajetória, realiza os cálculos de CCS utilizando técnicas de \textit{High Performance Computing} como paralelização, vetorização e otimização. Agora é possível calcular o CCS de maneira eficiente, desde para pequenas moléculas orgânicas até proteínas complexas com um número maior de átomos. Os resultados mostraram que, comparados com o software usado atualmente (MOBCAL), houve um ganho em média de 78 vezes em um nó de um cluster com 24 cores e 48 threads, utilizando Simultaneous Multithreading (SMT).